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过渡态结构建模

设置等价原子

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  • 初态结构:必须为有格子的结构,晶格常数、各元素原子总数需要和末态结构一致
  • 末态结构:必须为有格子的结构,晶格常数、各元素原子总数需要和初态结构一致
  • 全部重置:将所有配对原子重置
  • 重置:将当前所选配对原子重置
  • 自动匹配:根据序号和元素自动配对原子
  • 配对:将当前所选原子配对
  • 插点数:过渡态中的插点个数,默认将采用线性插值
  • 预览:完成所有原子配对后可点击进入预览窗口

预览

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  • 播放:点击上一帧、下一帧、播放按键或滑动滑块可以预览过渡态结构
  • 上一步:如果预览时发现匹配有误可返回上一步重新进行等价原子配对
  • 载入:确认无误后将过渡态结构导入新窗口

微调结构

载入后的结构,可以逐帧微调各image中原子的位置,以调整初始迁移路径。初态和末态结构不允许调整